I cavalli hanno solo tre colori di base: Baio, Nero o Sauro.

Questi diversi colori sono controllati da 2 loci, il Locus Extension (Rosso/Nero) e Locus Agouti.

Il locus Extension controlla la produzione di pigmento nero o rosso su tutto il mantello. L'allele per il colore nero (E) è dominante sull'allele rosso (e), quindi un cavallo ha bisogno di una sola copia dell'allele nero per apparire di base nero. Ma se il cavallo ha due alleli (e/e) apparirà Sauro.

Il locus Agouti può quindi modificare il pigmento nero spostandolo sulle punte del cavallo, creando un Baio. L'allele Agouti A è dominante, quindi un cavallo con pigmento nero ha bisogno di una sola copia (eterozigote) dell' A allele per apparire Baio. L'allele Agouti (a) è recessivo, quindi un cavallo ha bisogno di due copie (omozigote) dell'allele recessivo (a) al locus Agouti per apparire Nero.

Agouti non ha effetto sul pigmento rosso, ma l'allele rosso (e) è dominante sull'allele (a). Questo significa che un cavallo Sauro (e/e) può portare una o due copie dell'allele recessivo Agouti (a) e non apparirà diverso dai cavalli sauro con alleli dominanti Agouti (e/e a/a, e/e A/a, e/e A/A).