Grundfärgstest - loci A och E

Vad är skillnaden mellan genotyp och fenotyp?
Genotypen är det som står skrivet i hästens DNA. Den syns inte. Fenotypen är det som syns: i det här fallet färgen.
För varje gen har hästen två alleler: en från modern och en från fadern. Vi skriver till exempel A/a E/e.
Två hästar kan se likadana ut och ändå ha olika DNA. En A/A E/E-häst och en A/a E/e-häst har båda brun grundfärg. A/a E/e-hästen kan få föl med svart eller fux grundfärg; A/A E/E-hästen får bara föl med brun grundfärg.

Vad är skillnaden mellan grundfärg och djurets färg?
Grundfärgen är utgångspunkten. Det finns bara tre: brun, svart och fux. Den bestäms av två gener, Agouti och Extension.
Därefter kan andra modifierande gener ändra grundfärgen: späda ut den (göra den ljusare), avpigmentera den (ta bort färg) eller lägga till vita skäckmönster och andra mönster. Slutresultatet är djurets färg, den vi ser.
Exempel:
• Palomino: fux grundfärg med en Cream-allel.
• Gulbrun (buckskin): brun grundfärg med en Cream-allel.
• Skimmel: vilken som helst av de tre grundfärgerna, som Grey gradvis avpigmenterar med åldern.
Om de andra modifierande generna saknar varianter är djurets färg densamma som grundfärgen.

Varför bestämmer det här testet grundfärgen och inte djurets färg?
Eftersom testet bara läser av två gener, Agouti och Extension, och de två generna bestämmer bara grundfärgen. För att känna till djurets färg måste även de andra modifierande generna testas.

Vad gör varje locus?
Hästen kan producera två pigment: svart pigment och rött pigment.
Extension bestämmer vilket som produceras. Med minst en E-allel producerar hästen svart pigment. Med e/e producerar hästen bara rött pigment.
Agouti bestämmer var det svarta pigmentet hamnar. Med minst en A-allel stannar det svarta pigmentet i man, svans, underben och öronkanter: brun grundfärg. Med a/a täcker det svarta pigmentet hela kroppen: svart grundfärg.

Varför har en e/e-häst alltid fux grundfärg?
En e/e-häst producerar bara rött pigment. Agouti verkar bara på svart pigment. Utan svart pigment har Agouti inget att verka på, och hästen har fux grundfärg -/- e/e, oavsett vilken Agouti den har. Men Agouti-allelerna finns kvar i DNA:t och förs vidare till fölen.

Varför har en a/a-häst svart grundfärg bara om den har E-allelen?
a/a sprider det svarta pigmentet över hela kroppen. Men svart pigment finns bara om hästen har minst en E-allel. Alltså: a/a E/- är svart grundfärg; a/a e/e är fux grundfärg.

Vad betyder strecket i A/- eller -/-?
Strecket betyder ”vilken allel som helst”. Det används när den allelen inte ändrar grundfärgen.
• A/- E/- kan vara A/A E/E, A/a E/E, A/A E/e eller A/a E/e: alla har brun grundfärg.
• -/- e/e kan vara A/A e/e, A/a e/e eller a/a e/e: alla har fux grundfärg.

Om jag redan ser min hästs färg, vad ska jag då ha testet till?
Därför att man inte kan se på hästen vad den kan föra vidare till sina föl. En A/A E/E-häst och en A/a E/e-häst ser likadana ut men får olika föl. Bara DNA-testet visar vilken som är vilken.

Kan två hästar med brun grundfärg som paras med varandra få ett föl med svart eller fux grundfärg?
Ja, om båda är A/a E/e. Mendelsk sannolikhet för varje föl:
• 56,25 % brun grundfärg A/- E/-
• 18,75 % svart grundfärg a/a E/-
• 25 % fux grundfärg -/- e/e

Kan två hästar med svart grundfärg som paras med varandra få ett föl med fux grundfärg?
Ja, om båda är a/a E/e. Mendelsk sannolikhet för varje föl:
• 75 % svart grundfärg a/a E/-
• 25 % fux grundfärg a/a e/e

Vilka föl får två hästar med fux grundfärg som paras med varandra?
100 % föl med fux grundfärg -/- e/e, eftersom båda bara kan föra vidare e-allelen.

Vilken häst får 100 % föl med brun grundfärg?
En A/A E/E-häst. Den för alltid vidare A-allelen och E-allelen till varje föl. Därför får alla föl brun grundfärg A/- E/-, oavsett den andra föräldern.

Hur får man föl med svart grundfärg?
För att det ska vara möjligt: varje förälder måste ha minst en a-allel, och minst en av föräldrarna måste ha E-allelen.
För 100 % sannolikhet: båda föräldrarna måste vara a/a och minst en måste vara E/E.

Varför är det här testet viktigt för den som föder upp svarta hästar?
Frieserhästen är alltid svart. I Portugal föder Coudelaria Ortigão Costa bara upp svarta hästar av rasen Lusitano. För att behålla svart grundfärg hos alla föl måste uppfödaren veta vilka avelsdjur som är a/a E/E och vilka som bär på e-allelen (a/a E/e). Två a/a E/e-hästar parade med varandra har 25 % sannolikhet att få ett föl med fux grundfärg a/a e/e. En a/a E/E-hingst får 100 % föl med svart grundfärg med vilket a/a-sto som helst. Bara DNA-testet identifierar bärarna.

Kan en häst med fux grundfärg få föl med svart grundfärg?
Ja, om den har a-allelen (A/a e/e eller a/a e/e). Exempel: en a/a e/e-häst parad med en a/a E/E-häst får 100 % föl med svart grundfärg a/a E/e. Därför spelar Agouti hos en häst med fux grundfärg roll vid valet av parningspartner.

Hur skiljer man en mycket mörkbrun grundfärg från en svart grundfärg?
Med blotta ögat kan det vara svårt. Med DNA-testet är det säkert: brun grundfärg A/- E/-; svart grundfärg a/a E/-.

Min skimmel visar inte sin grundfärg. Kan den testas?
Ja. Grey avpigmenterar gradvis pälsen med åldern, men DNA:t förändras inte. Testet bestämmer den grundfärg hästen föddes med.

I vilken ålder kan en häst testas?
I vilken ålder som helst. DNA:t är detsamma från födseln.

Vilket prov ska jag skicka?
20 till 40 hårstrån dragna ur manen eller svansen, med rötterna, eller 5 mL helblod i ett K3-EDTA-rör, taget av veterinär. Ett enda prov räcker för båda generna.

När får jag resultaten?
Inom 5 till 10 arbetsdagar efter att provet har kommit fram till laboratoriet. Den certifierade rapporten skickas så snart analysen har validerats.