Les signes cliniques varient en fonction de la zone du cerveau ou de la moelle épinière affectée. Les trois « A » caractéristiques de l'EPM sont :

• Asymétrie est un terme que nous utilisons pour décrire un symptôme qui est plus marqué d'un côté du corps que de l'autre. En d'autres termes, avec l'EPM, les signes sont généralement plus prononcés du côté gauche que du côté droit, ou inversement. 
• Ataxie est un terme que nous utilisons pour décrire une incoordination ou l'incapacité du cheval à savoir exactement où se trouvent ses jambes, ce qui entraîne une incapacité à bouger normalement ses jambes et son tronc.
• Atrophie décrit une condition où les muscles rétrécissent par rapport à leur taille normale. Avec l'EPM, cela résulte de lésions des nerfs qui contrôlent normalement ou « innervent » ces muscles. L'atrophie musculaire n'est pas observée dans tous les cas d'EPM, elle n'est donc pas un signe aussi constant de la maladie que l'ataxie asymétrique.