Test de couleur de base - loci A et E

Quelle est la différence entre génotype et phénotype ?
Le génotype est ce qui est écrit dans l'ADN du cheval. Il ne se voit pas. Le phénotype est ce qui se voit : ici, la robe.
Pour chaque gène, le cheval possède deux allèles : l'un hérité de la mère, l'autre du père. On écrit, par exemple, A/a E/e.
Deux chevaux peuvent se ressembler et être différents dans leur ADN. Un cheval A/A E/E et un cheval A/a E/e ont tous deux une robe de base baie. Le cheval A/a E/e peut avoir des poulains de robe de base noire ou alezane ; le cheval A/A E/E n'a que des poulains de robe de base baie.

Quelle est la différence entre robe de base et robe de l'animal ?
La robe de base est le point de départ. Il n'y en a que trois : bai, noir et alezan. Elle est déterminée par deux gènes, Agouti et Extension.
Ensuite, d'autres gènes modificateurs peuvent changer la robe de base : la diluer (l'éclaircir), la dépigmenter (lui retirer sa couleur) ou y ajouter des panachures et d'autres motifs. Le résultat final est la robe de l'animal, celle que l'on voit.
Exemples :
• Palomino : robe de base alezane avec un allèle Cream.
• Isabelle (buckskin) : robe de base baie avec un allèle Cream.
• Gris : n'importe laquelle des trois robes de base, que le gène Grey dépigmente progressivement avec l'âge.
Si les autres gènes modificateurs ne présentent pas de variants, la robe de l'animal est identique à la robe de base.

Pourquoi ce test détermine-t-il la robe de base et non la robe de l'animal ?
Parce que le test ne lit que deux gènes, Agouti et Extension, et que ces deux gènes ne déterminent que la robe de base. Pour connaître la robe de l'animal, il faut aussi tester les autres gènes modificateurs.

Que fait chaque locus ?
Le cheval peut produire deux pigments : le pigment noir et le pigment rouge.
Extension détermine lequel est produit. Avec au moins un allèle E, le cheval produit du pigment noir. Avec e/e, le cheval ne produit que du pigment rouge.
Agouti détermine où se place le pigment noir. Avec au moins un allèle A, le pigment noir reste uniquement sur les extrémités (crinière, queue, bas des membres et bord des oreilles) : robe de base baie. Avec a/a, le pigment noir couvre tout le corps : robe de base noire.

Pourquoi un cheval e/e est-il toujours de robe de base alezane ?
Un cheval e/e ne produit que du pigment rouge. Agouti n'agit que sur le pigment noir. Sans pigment noir, Agouti n'a rien sur quoi agir, et le cheval est de robe de base alezane -/- e/e, quel que soit son Agouti. Mais les allèles Agouti restent dans l'ADN et sont transmis aux poulains.

Pourquoi un cheval a/a n'est-il de robe de base noire que s'il possède l'allèle E ?
Le génotype a/a répartit le pigment noir sur tout le corps. Mais il n'y a de pigment noir que si le cheval possède au moins un allèle E. Donc : a/a E/- est de robe de base noire ; a/a e/e est de robe de base alezane.

Que signifie le tiret dans A/- ou -/- ?
Le tiret signifie « n'importe quel allèle ». On l'utilise quand cet allèle ne change pas la robe de base.
• A/- E/- peut être A/A E/E, A/a E/E, A/A E/e ou A/a E/e : tous ont une robe de base baie.
• -/- e/e peut être A/A e/e, A/a e/e ou a/a e/e : tous ont une robe de base alezane.

Si je vois déjà la robe de mon cheval, à quoi sert le test ?
Parce qu'en regardant le cheval, on ne voit pas ce qu'il peut transmettre à ses poulains. Un cheval A/A E/E et un cheval A/a E/e se ressemblent, mais n'ont pas les mêmes poulains. Seul le test ADN montre lequel est lequel.

Deux chevaux de robe de base baie croisés entre eux peuvent-ils avoir un poulain de robe de base noire ou alezane ?
Oui, si les deux sont A/a E/e. Probabilité mendélienne pour chaque poulain :
• 56,25 % robe de base baie A/- E/-
• 18,75 % robe de base noire a/a E/-
• 25 % robe de base alezane -/- e/e

Deux chevaux de robe de base noire croisés entre eux peuvent-ils avoir un poulain de robe de base alezane ?
Oui, si les deux sont a/a E/e. Probabilité mendélienne pour chaque poulain :
• 75 % robe de base noire a/a E/-
• 25 % robe de base alezane a/a e/e

Quels poulains donnent deux chevaux de robe de base alezane croisés entre eux ?
100 % de poulains de robe de base alezane -/- e/e, car les deux ne peuvent transmettre que l'allèle e.

Quel cheval a 100 % de poulains de robe de base baie ?
Un cheval A/A E/E. Il transmet toujours l'allèle A et l'allèle E à chaque poulain. Tous ses poulains sont donc de robe de base baie A/- E/-, quel que soit l'autre parent.

Comment obtenir des poulains de robe de base noire ?
Pour que ce soit possible : chaque parent doit avoir au moins un allèle a, et au moins l'un des parents doit avoir l'allèle E.
Pour 100 % de probabilité : les deux parents doivent être a/a et au moins l'un d'eux doit être E/E.

Pourquoi ce test intéresse-t-il les éleveurs de chevaux noirs ?
Le cheval Frison est toujours noir. Au Portugal, la Coudelaria Ortigão Costa n'élève que des chevaux Pur-sang lusitanien noirs. Pour maintenir la robe de base noire chez tous les poulains, l'éleveur doit savoir quels reproducteurs sont a/a E/E et lesquels sont porteurs de l'allèle e (a/a E/e). Deux chevaux a/a E/e croisés entre eux ont 25 % de probabilité d'avoir un poulain de robe de base alezane a/a e/e. Un étalon a/a E/E a 100 % de poulains de robe de base noire avec n'importe quelle jument a/a. Seul le test ADN identifie les porteurs.

Un cheval de robe de base alezane peut-il avoir des poulains de robe de base noire ?
Oui, s'il possède l'allèle a (A/a e/e ou a/a e/e). Exemple : un cheval a/a e/e croisé avec un cheval a/a E/E a 100 % de poulains de robe de base noire a/a E/e. C'est pourquoi l'Agouti d'un cheval de robe de base alezane compte dans le choix du partenaire d'accouplement.

Comment distinguer une robe de base baie très foncée d'une robe de base noire ?
À l'œil, cela peut être difficile. Avec le test ADN, c'est certain : robe de base baie A/- E/- ; robe de base noire a/a E/-.

Mon cheval gris ne montre pas sa robe de base. Peut-il être testé ?
Oui. Le gène Grey dépigmente progressivement la robe avec l'âge, mais l'ADN ne change pas. Le test détermine la robe de base avec laquelle le cheval est né.

À quel âge un cheval peut-il être testé ?
À tout âge. L'ADN est le même depuis la naissance.

Quel échantillon dois-je envoyer ?
20 à 40 crins arrachés de la crinière ou de la queue, avec les racines, ou 5 mL de sang total dans un tube K3-EDTA, prélevé par un vétérinaire. Un seul échantillon suffit pour les deux gènes.

Quand vais-je recevoir les résultats ?
Sous 5 à 10 jours ouvrés après l'arrivée de l'échantillon au laboratoire. Le rapport certifié est envoyé dès que l'analyse est validée.