La maladie du cheval africain peut provoquer des maladies respiratoires (pulmonaires), cardiaques (du cœur) ou une fièvre cyclique. Le taux de mortalité peut atteindre 95 % pour certaines formes de la maladie.

La forme pulmonaire ou respiratoire se manifeste rapidement (en quelques jours).

Les signes de la maladie incluent fièvre, difficulté à respirer, toux, transpiration et écoulement mousseux par les narines. La mort survient généralement quelques heures après l'apparition des symptômes.

La forme cardiaque de la maladie provoque fièvre et gonflement (œdème) autour des yeux, des lèvres, des joues, de la langue et du cou. La mort survient généralement à cause d'une insuffisance cardiaque.

Certains animaux affectés peuvent présenter à la fois des signes pulmonaires et cardiaques de la maladie.

Certains animaux peuvent ne développer qu'une fièvre cyclique (élevée l'après-midi, disparue le matin). Ces animaux peuvent également présenter une dépression et une diminution de l'appétit. Les animaux atteints de cette forme fébrile de la maladie du cheval africain se rétablissent généralement.