La febbre dell'equide africana può causare malattie respiratorie (polmonari), cardiache (del cuore) o una febbre ciclica. I tassi di mortalità possono arrivare fino al 95% per alcune forme della malattia.

La forma polmonare o respiratoria si manifesta rapidamente (entro pochi giorni).

I segni della malattia includono febbre, difficoltà respiratorie, tosse, sudorazione e secrezione schiumosa dalle narici. La morte di solito avviene entro poche ore dall'insorgenza della malattia.

La forma cardiaca della malattia provoca febbre e gonfiore (edema) intorno agli occhi, alle labbra, alle guance, alla lingua e al collo. La morte di solito avviene a causa di insufficienza cardiaca.

Alcuni animali colpiti possono presentare sia segni polmonari che cardiaci della malattia.

Alcuni animali possono sviluppare solo una febbre ciclica (alta nel pomeriggio, scomparsa al mattino). Questi animali possono anche manifestare depressione e diminuzione dell'appetito. Gli animali con questa forma febbrile della febbre dell'equide africana di solito guariscono.